高町奈叶（田村由香里 配音）是一位平凡的高中三年级学生，某日，在上学的路上，她同来自异世界米德其路达的尤诺（水桥香织 配音）相遇了。尤诺告诉奈叶，她正在寻找遗落人间的太古遗产“圣石之种”，这种珍贵的宝

一场只是“接案偷东西”的任务，意外救下遭追杀的神秘少女。他们从此卷入社会上层的腐败与阴谋，踏上危机四伏的亡命冒险。世界，远比你想像得还要丑陋……

蝙蝠侠和他的盟友们从过去回来后仅仅一天就发现世界已经和他们离开时大不相同了。整个日本岛不复存在，正义联盟的英雄们也不复存在。但他们还没来得及弄清楚发生了什么，黑帮就开始从天而降。